在百子成功渡过地表入侵，山地基因危机，Ari智能危机以及天幕辐射危机的5年后，天空人和小oHeda指导的地表人又回到了空中。　　在重建家园的时分，不测发现大战前美国国防树立的海底智能化基地由于备用供电终止，浮出水面。　　在探求后发现，基地并没有幸存者。　　在修好了供电设备后，天空人进入了海底基地的控制系统，原来这是在热战时期就末尾研发的太空战基地，之所以修在海底是为了平安和保密。　　海底基地可以接入还在运转的军事卫星，不测发现美国曾经偷偷和宇宙的神族文明取得了联络，神族文明的外交舰队已在百年前动身，如今已进入银河系的边缘。　　神族文明发现地球文明曾经不复存在。　　同时ari事先备份在宇宙空间站的系统错误判定神族文明的来意，希望他们能协助人类重建家园。　　但是神族文明却已末尾了殖民地球的方案。　　外交舰队的义务是消灭地球残留文明树立新的次第。　　天空人和地表人将如何应用地球发展的文明击败宇宙神族将是本季的亮点。　　基本剧情设定，神族文明也是碳基生物，具有和人类相似的外形，其武器也是基于量子力学开发的，只不过比人类当年科技全胜的要先进。　　神族文明当年和地球文明相互发现后，以为地球文明的科技具有爆炸性，未必能在抵达地球后仍坚持技术抢先，不过由于关于未知世界的猎奇，他们派出了2艘星舰和1w名神族战士的外交舰队。